他是明教护教法王，跟随方腊起兵，力大枪沉，反被徐宁一招秒杀
提到明教，很多人都想到《倚天屠龙记》中的明教教主张无忌，但明教其实跟《水浒传》也有着些许的联系。明教的正式名称，称作摩尼教，也写作牟尼教。最早发源于古波斯的祆教，公元三世纪时，波斯人摩尼杂糅了祆教、基督教甚至还有佛教的思想，创建了二元论宗教，而且崇尚光明。
公元六世纪到七世纪，摩尼教传入西域地区，在经过现在的新疆北传到回纥汗国，并在那里盛行。而大唐是兼容并包的多民族国家，回纥可汗骨力裴罗也是在大唐的帮助下，一统草原，唐玄宗还封其为怀仁可汗。唐肃宗平定安史之乱，朔方节度使郭子仪上表劝皇帝向回纥借兵平叛。两个国家交往密切，有很多回纥商人或是回纥族人南下，投奔大唐，在内地定居。
甚至有很多回纥人，担任唐朝的地方官员，或是在唐军中以个人身份直接服役，唐政府为了照顾他们，又在当时很多大城市设有摩尼寺。直到回纥后来跟唐朝关系恶化，唐朝开始抄没摩尼教在中原的寺庙田产。等到唐武宗灭佛的时候，摩尼教遭到彻底打击，更名为明教，并转入了地下，改成秘密宗教，并吸收了中国本土的道教和民间当地信仰神祗。
从唐代中晚期开始，这些信徒揭竿而起，但效果不大，往往没有成事便被扑灭。直到北宋末年宋徽宗宣和年间，道君天子爱的是琴棋书画，喜的是花石竹木。他的爪牙为了满足他的去求，在江南设立苏杭应奉局，盘剥百姓。江南人民因花石纲事件而矛盾激化，纷纷吃菜事魔，信仰明教，人心思变。而浙江清溪县因为盛产竹木漆，也成为受盘剥的重灾区。
雇工出身的方腊，利用明教二宗三际之说，于1120年秋，在睦州帮源发动起义，字号“圣公”，建年号“永乐”，设置文武百官，联络各路民间反宋力量。为了扑灭这股起义，宋军征发附近州城府县的百姓，为宋军送粮。台州仙居的吕师囊，原本是当地的富户，平时乐善好施，仗义疏财，被人们比作战国时代四大公子之一“信陵君”，所以吕师囊的外号也被叫做吕信陵。
但吕师囊得罪官府，被盘剥陷害，在一次偶然的机会，吕师囊加入摩尼教，后来成为当地摩尼教的首领。而不堪被欺压的吕师囊带领农民兄弟，杀死监押他们的官兵，响应方腊起义。当时响应方腊的江南群众，人数多达几十万。吕师囊也是教中重要的头目，好似武侠小说中的护教法王一般。他曾带领人马攻打台州城。但台州城高池深，起义的农民是揭竿而起，没有接受过攻坚战训练，也不会制造攻城器械，是役虽耗时几个月，但吕师囊义军无功而返。
方腊被擒后，吕师囊还带人坚持抗宋，宋军将领折可存追击吕师囊到黄岩县断头山，虽然吕师囊据险而守，但最终寡不敌众，全军覆没。吕师囊被生擒后，押解至台州府临海县，被乱箭攒心后，再被分。宣抚使童贯下令将吕师囊的亲族和教友斩尽杀绝，吕师囊的家乡，也因出了这位“元凶首恶”而被报复的宋军夷灭，幸存的后人们在这里重建家园，改名为吕桥头村。
吕师囊在《水浒传》中，是以方腊麾下独当一面的大将军形象出场的，他原本是歙州富户，方腊起义后，因为献钱粮有功，被封为东厅枢密使。此人熟读兵书战册，爱使丈八蛇矛，戏剧《双烈记》中，称其“文过张良，武欺项羽”。吕师囊领兵镇守润州，麾下兵马五万，战将十二员，因为来自江南各地，绰号又是以上界星宿命名，得名“江南十二神”。
这群人让梁山军损兵折将，宋江哭断肠。要不是因为吕师囊刚愎自用，好大喜功，润州也不会被攻破。镇守苏州的是方腊的亲弟，三大王方貌，听闻吕师囊丧师辱国，要将其斩首。被人劝说下，命令吕师囊带领五千军兵，迎战梁山宋江军。
吕师囊在最后时刻，披挂整齐，原文中还有赞诗为证：
头带茜红巾，身披锦战袍。内穿黄金甲，外系彩绒绦。马振铜铃响，身腾杀气高。乾坤无敌手，当阵逞英豪。
但可惜，“以为能碾压，结果被吊打”吕师囊跟金枪手徐宁交手仅二十合，便被徐宁用钩镰枪戳于马下，这位在明教历史留下浓墨重彩一笔的豪杰，在《水浒传》中的戏份正式杀青。