窦氏年幼时被舅舅周武帝宇文邕抚养于宫中,很受宠爱。她曾因劝谏周武帝接近和亲的突厥公主而得到周武帝称赞,以为她小小年纪,才智非凡。有记载称其时的名将长孙晟传闻这件事今后,对朋友说“此奇人必有奇子,可为婚姻”。几十年后,长孙晟去世,他的内兄高士廉做主将长孙晟的小女儿嫁给窦氏的二儿子李世民,也便是后来的长孙皇后。
她在李渊反隋之前就去世了,传闻生前从前劝说李渊不要把好马留在家里,要及早献给皇帝,避免引起隋炀帝嫉妒。李渊其时没有听从,然后来不得不被迫献马以消除隋炀帝的猜疑。李渊回想窦氏最初的劝言,叹气着对子女们说:“假如我早听了你们母亲的话,哪里到这地步。”李渊登基今后,追封她为皇后,并追谥为太穆皇后。李渊之后不曾再立皇后。
又过了几天,朝廷突然降诏书宣召李渊去见隋炀帝。李渊吓得心惊肉跳,心想这下可完了,隋炀帝肯定是置疑到他的头上,遭致李浑那样的下场。他踌躇一再,觉得凶多吉少,仍是不去为妙,于是,装病,向朝廷的青鸟使说自己重病在身,无法去朝见皇帝,又拿出许多金银,托朝廷青鸟使复命时在隋炀帝面前尽力周旋。青鸟使受了重贿,天然照办不误。隋炀帝传闻李渊病得厉害,也就算了。
时间不长,李渊的皇后窦氏病死涿郡(今北京西南),享年四十五岁。李渊非常悲伤。他想,自己要是早点听妻子的劝说,也不至于落到今天这样危险的地步。他决计按窦小姐生前的主张,采用韬晦之计,故意放纵声色,收受部属的贿赂,做一个贪财好色的赃官,以此来掩盖自已实在的心里活动。果然,当隋炀帝的耳目把李渊这种情形禀告之后,隋炀帝便对李渊放心了。李渊还千方百计投隋炀帝所好,不惜重金网罗快马和鹰犬,常常进献给隋炀帝,使隋炀帝对李渊越来越信赖了。大业十一年,加授山西河东慰抚大使;大业十二年,迁右骁卫将军;十三年,升任太原留守。到这时,李渊愈加感念妻子窦小姐的真知灼见,他把四个儿子召来,流着眼泪对他们说:“假如最初我听你们母亲一句话,早就能够做到这样的职位了!”
后来,李渊在太原起兵,进而开创帝业,做了唐皇朝的第一任皇帝。为了纪念这位才貌双全,同自己患难与共的原配妻子窦氏,他即位后追册窦氏为太穆皇后。虽然晚年的李渊姬妾成群,沉湎于色,但后宫一直不立皇后,算是尽了他对窦氏的一点夫妻之情。