虽然是尊贵的格格,但是莽古济的命运仍需要努尔哈赤的来定夺,还是没有逃过政治联姻的命运,莽古济成为父亲拉拢部落首领的棋子。他想统一女真,把莽古济嫁给孟格布禄的儿子武尔古岱是统一海西四部的一个策略,这段历史在《满族大辞典》中有提到:“莽古济格格,明万历二十九年正月原拟嫁被俘之哈达部贝勒孟格布禄。后发觉孟格布禄与努尔哈赤侍妾通奸,并欲谋反,为努尔哈赤所杀。为维系人心,努尔哈赤将莽古济嫁其子武尔古岱。”这段婚姻还是不错的,武尔古岱涉世未深,虽不是赫赫有名的大英雄,但却是一个老实人,这段婚姻维持了20多年,莽古济也没有辜负努尔哈赤的期望,她把哈达部最真实的情况及时汇报给建州方面。终于努尔哈赤抓住机会,一举歼灭哈达。
武尔古岱病逝,慢慢莽古济看清了一些问题,以前的日子虽然平淡,但也是真诚美好的,自己的丈夫平庸而质朴,对自己也是很好的,人往往在失去后,才放知他的珍贵。
天命十一年八月,自己的父亲努尔哈赤也不幸逝世,母亲、父亲先后去世,让莽古济成为了孤儿,自己的靠山都不在了,莽古济的心中无限凄凉。经过不断的协商,最后以四贝勒皇太极的胜出而结束,皇太极成为新的汗王。
莽古济一直过着寡居生活,蒙古敖汉部的归顺给莽古济的生活带来了翻天覆地的变化。皇太极为了拉拢蒙古,又把这个姐姐远嫁蒙古。但这次的婚姻给莽古济带来的是巨大的痛苦,蒙古部首领索诺木杜陵早已妻妾成群,莽古济不得丈夫的宠爱,这对同床异梦的半路夫妻谁看谁都不顺眼,杜陵这个人权力欲望很大,也是在百般无奈之下才投降皇太极,杜陵觉得莽古济是来监视他的,杜陵对莽古济的防范心很重,加上外界的压力,这个哈达公主终于爆发了,她密谋自己的哥哥莽古尔泰向皇太极设鸿门宴。没想到杜陵出卖了她,向皇太极告密。
这件事无论是不是真的,但却为皇太极铲除异己找了一个很好的借口,莽古济和她的党羽全部被抓,一千多人全部被处死,莽古济这个尊贵的格格也被凌迟处死。