孔宏智

孔宏智（1973年10月-），男，博士，研究员，博士生导师。1995年毕业于西北大学生物系，2000年在中国科学院植物研究所获得博士学位并留所工作。2002年4月至2004年10月在美国宾夕法尼亚州立大学进行合作研究。主要从事被子植物花的进化发育遗传学、核基因家族和调控网络的进化以及植物系统发育和分子生物地理学研究。对被子植物花部结构的多样性有较为深入的了解，熟悉花的发育和核基因家族的进化。主持了国家自然科学基金之青年基金项目“金粟兰科的系统发育和分子生物地理学研究”、主任基金项目“被子植物中最简单的花的发育与进化”、面上基金项目“金粟兰中5个MADS-box基因的功能与进化研究”和重点基金项目“基部真双子叶植物中A、B、C和E类MADS-box基因的进化”。《植物学报》和《植物分类学报》等刊物上发表论文十余篇。现任第十四届全国政协委员、农业和农村委员会委员。

基本资料

中文名：孔宏智

出生日期：1973年10月

毕业院校：西北大学、中国科学院植物研究所

主要成就：2017年获得首届吴征镒植物学奖青年创新奖

出生地：陕西省凤翔县

职称：研究员、博士生导师

性别：男

学历：博士研究生

个人简介

部门：系统与进化植物学国家重点实验室

课题组：进化发育与调控基因组学责任研究组

研究领域：进化发育生物学、调控基因组学

1995年毕业于西北大学生物系，2000年在中国科学院植物研究所获得博士学位并留所工作。2002年4月至2004年10月在美国宾夕法尼亚州立大学进行合作研究。主要从事被子植物花的进化发育遗传学、核基因家族和调控网络的进化以及植物系统发育和分子生物地理学研究。对被子植物花部结构的多样性有较为深入的了解，熟悉花的发育和核基因家族的进化。主持了国家自然科学基金之青年基金项目“金粟兰科的系统发育和分子生物地理学研究”、主任基金项目“被子植物中最简单的花的发育与进化”、面上基金项目“金粟兰中5个MADS-box基因的功能与进化研究”和重点基金项目“基部真双子叶植物中A、B、C和E类MADS-box基因的进化”。

人物经历

1991.09–1995.07西北大学生物学系，获学士学位

1995.09–2000.07中国科学院植物研究所，获博士学位

2000.08–2003.05中国科学院植物研究所，助理研究员

2002.04–2004.10美国宾夕法尼亚州立大学，访问博士后

2003.06–2006.12中国科学院植物研究所，副研究员

2006.12–中国科学院植物研究所，研究员

2007.06–中国科学院植物研究所，博士生导师

2008.07–进化发育与调控基因组学责任研究组，组长

北京市第十五、十六届人民代表大会代表。

担任职务

第十四届全国政协委员、农业和农村委员会委员

科研项目

中国科学院王宽诚率先人才计划卢嘉锡国际团队项目“植物发育、分化与适应性进化国际团队”（GJTD-2020-05;300万;2021.01-2023.12）。

国家自然科学基金重点项目“毛茛科植物花瓣蜜距起源和多样化的分子机制研究”（31930008;直接经费307万;2020.01-2024.12）。

中国科学院基础前沿科学研究计划从0到1原始创新项目“叶性器官形状和结构的复杂化和多样化：从数学模拟到分子机制的解析”（ZDBS-LY-SM002;300万;2019.09-2024.09）。

中国科学院战略性先导科技专项（B类）之子课题“花瓣形态和结构多样化的遗传基础”（XDB27010304;直接经费225万;2018.06-2023.05）。

国家自然科学基金“微进化过程的多基因作用机制”重大研究计划之集成项目“新性状起源的分子机制和叠加效应研究——以黑种草属植物花瓣的表型复杂化为例”（91631308;直接经费275万;2017.01-2019.12）。

国家自然科学基金重点项目“毛茛科植物花瓣形态和结构的适应性进化及其分子机制研究”（31330007;320万;2014.01-2018.12）。

中国科学院科技创新交叉与合作团队项目“Eco-Evo-Devo与Genomics创新团队”（100万;2013.01-2015.12）。

国家杰出青年科学基金项目“植物进化与发育”（31125005;240万;2012.01-2015.12）。

科技部重大科学研究计划项目“植物减数分裂过程中染色体相互作用的分子机理”之课题“减数分裂共性和特性的分子基础”（2011CB944604;428万;2011.01-2015.08）。

国家自然科学基金面上项目“重复基因在编码区分化的机制及其进化意义的研究”（30970210;35万;2010.01-2012.12）。

“花部性状发育和演化的遗传调控及其分子机制”，中国科学院知识创新工程重要方向项目（KSCX2-YW-R-135;100万;2007.01-2010.12），主持人。

“基部真双子叶植物中A、B、C和E类MADS-box基因的进化”，国家自然科学基金委重点基金项目（30530090;160万;2006.01-2009.12），主持人。

“金粟兰中5个MADS-box基因的功能与进化研究”，国家自然科学基金委面上基金项目（30470116;21万;2005.01-2007.12），主持人。

“植物进化机制的进化发育生物学研究”之子课题“AP3类MADS-box基因的功能及其进化研究”，国家自然科学基金委创新研究群体基金项目（30121003;35万;2005.01-2007.12），主持人。

“植物进化过程中关键性状的进化发育遗传学研究”，中国科学院植物研究所领域前沿项目（100万;2005.12-2008.11），主持人。

“被子植物中最简单的花的发育与进化”，国家自然科学基金委主任基金项目（30240002;15万;2002.05-2003.04），主持人。

“金粟兰科的系统发育和分子生物地理学研究”，国家自然科学基金委青年基金项目（30100011;19万;2002.01-2004.12），主持人。

“金粟兰属植物花部器官的发育与进化”，中国科学院植物研究所系统与进化植物学开放研究实验室基金课题（6万;2000.01-2002.12），主持人。

“原始被子植物的结构、分化和演化”，路安民研究员主持的国家自然科学基金委重点基金项目（39630030;100万;1997.01-2000.12），参加人。

“被子植物基部类群的结构、分化和系统学关系”，路安民研究员主持的国家自然科学基金委重点基金项目（30130030;105万;2002.01-2005.12），参加人。

“横断山脉地区种子植物区系中的特有现象和物种形成的研究”，杨亲二研究员主持的中国科学院资源与生态环境研究重点项目（KSCXZ-SW-101A;25万;1997.01-1999.12），参加人。

“横断山区乌头属植物物种形成与分化的研究”，杨亲二研究员主持的国家自然科学基金委面上基金项目（30070057;15万;2001.01-2003.12），参加人。

“高山松的基因组构成和进化生物学研究”，王晓茹研究员主持的国家自然科学基金委面上基金项目（30070058;15万;2001.01-2003.12），参加人。

主要研究领域

1．花的进化发育遗传学

采用进化、发育和遗传手段，研究控制花部器官发生和发育的关键基因（如A、B、C和E类MADS-box基因）的数目、结构、表达、功能和进化，揭示新基因、新基因功能乃至新调控体系产生的基本式样及其与花部结构改变的关系，探讨关键花部性状起源和演化的分子机理以及被子植物大类群的起源和多样化机制。目前的研究重点是基部真双子叶植物花部结构的多样化机制和核心真双子叶植物花部结构的起源机制。

2．核基因家族和调控网络的进化

利用分子进化和生物信息学研究手段，在基因组的层面上研究核基因家族的结构、变异、起源和演化，揭示调控网络（regulatorynetworks）和发育途径（developmentalpathways）中各结点基因和相互作用关系的保守性和变异式样，探讨控制重要生命活动（如蛋白质降解、细胞周期和减数分裂等）的起源、维持和多样化机制。近年来的研究主要集中在SKP1、F-box、Cyclin和recA/RAD51等基因家族的进化上。

3．植物系统发育和分子生物地理学

在形态学（广义）、细胞学和分子系统学研究的基础上，重建植物类群（如金粟兰科）的系统发育，并结合植物地理学和古生物、古地理和古气候的资料，探讨类群的起源、演化和分布历史。

奖项和荣誉

2017年获得首届吴征镒植物学奖青年创新奖

研究论文

83.LiuP.,ZhangX.,MaoJ.,HongY.,ZhangR.,EY.,NieS.,JiaK.,JiangC.,HeJ.,ShenW.,HeQ.,ZhengW.,AbbasS.,JewariaP.K.,TianX.,LiuC.,JiangX.,YinY.,LiuB.,WangL.,JinB.,MaY.,QiuZ.,BaluskaF.,SamajJ.,HeX.,NiuS.,XieJ.,XieL.,XuH.,KongH.,GeS.,DixonR.A.,JiaoY.*;LinJ.*,2020.TheTetracentrongenomeprovidesinsightintotheearlyevolutionofeudicotsandtheformationofvesselelements.GenomeBiology21:291.

82.DuanX.,ZhaoC.,JiangY.,ZhangR.,ShanH.*,KongH.*,2020.Parallelevolutionofapetalouslineageswithinthebuttercupfamily(Ranunculaceae):outwardexpansionofAGAMOUS1,ratherthandisruptionofAPETALA3-3.ThePlantJournal104:1169-1181.

81.ZhangR.,FuX.,ZhaoC.,ChengJ.,LiaoH.,WangP.,YaoX.,DuanX.,YuanY.,XuG.,KramerE.M.,ShanH.,KongH.*,2020.IdentificationofthekeyregulatorygenesinvolvedinelaboratepetaldevelopmentandspecializedcharacterformationinNigelladamascena(Ranunculaceae).ThePlantCell32:3095-3112.(CommentedbyChrisWhitewoods,2020.ADamascenemoment:thegeneticbasisofcomplexpetalsinNigella.ThePlantCell32:3041-3042;recommendedbyPHYS.ORG:https://phys.org/news/2020-08-uncovering-developmental-mechanisms-elaborate-petals.html)

80.ZhangR.,MinY.,HolappaL.D.,Walcher-ChevilletC.L.,DuanX.,DonaldsonE.,KongH.,KramerE.M.*,2020.ArolefortheAuxinResponseFactorsARF6andARF8homologsinpetalspurelongationandnectarymaturationinAquilegia.NewPhytologist227:1392-1405.

79.JiangY.,WangM.,ZhangR.,XieJ.,DuanX.,ShanH.,XuG.*,KongH.*,2020.IdentificationofthetargetgenesofAqAPETALA3-3(AqAP3-3)inAquilegiacoerulea(Ranunculaceae)helpsunderstandthemolecularbasesoftheconservedandnonconservedfeaturesofpetals.NewPhytologist227:1235-1248.

78.XieJ.,ZhaoH.,LiK.,ZhangR.,JiangY.,WangM.,GuoX.,YuB.,KongH.*,JiaoY.*,XuG.*,2020.Achromosome-scalereferencegenomeofAquilegiaoxysepalavar.kansuensis.HorticultureResearch7:113.

77.LiaoH.,FuX.,ZhaoH.,ChengJ.,ZhangR.,YaoX.,DuanX.,ShanH.,KongH.*,2020.Themorphology,moleculardevelopmentandecologicalfunctionofpseudonectariesonNigelladamascena(Ranunculaceae)petals.NatureCommunications11:1777.(RecommendedbyFacultyOpinions:https://facultyopinions.com/prime/737746780andPlantScienceResearchWeeklyofPlantae;featuredarticleofNatureCommunications:https://www.nature.com/collections/jgjcebchgg)

76.ZhangJ.,FuX.,LiR.,ZhaoX.,LiuY.,LiM.,ZwaenepoelA.,MaH.,GoffinetB.,GuanY.,XueJ.,LiaoY.,WangQ.,WangQ.,WangJ.,ZhangG.,WangZ.,JiaY.,WangM.,DongS.,YangJ.,JiaoY.,GuoY.,KongH.,LuA.,YangH.,ZhangS.*,VandePeerY.*,LiuZ.*,ChenZ.*,2020.Thehornwortgenomeandearlylandplantevolution.NaturePlants6:107-118.

75.ZhangL.*,ChenF.,ZhangX.,LiZ.,ZhaoY.,LohausR.,ChangX.,DongW.,HoS.Y.W.,LiuX.,SongA.,ChenJ.,GuoW.,WangZ.,ZhuangY.,WangH.,ChenX.,HuJ.,LiuY.,QinY.,WangK.,DongS.,LiuY.,ZhangS.,YuX.,WuQ.,WangL.,YanX.,JiaoY.,KongH.,ZhouX.,YuC.,ChenY.,LiF.,WangJ.,ChenW.,ChenX.,JiaQ.,ZhangC.,JiangY.,ZhangW.,LiuG.,FuJ.,ChenF.,MaH.,VandePeerY.,TangH.,2020.Thewaterlilygenomeandtheearlyevolutionoffloweringplants.Nature577:79-84.

74.ShanH.,ChengJ.,ZhangR.,YaoX.,KongH.*,2019.Developmentalmechanismsinvolvedinthediversificationofflowers.NaturePlants5:917-923.

73.YaoX.,ZhangW.,DuanX.,YuanY.,ZhangR.,ShanH.,KongH.*,2019.ThemakingofelaboratepetalsinNigellathroughdevelopmentalrepatterning.NewPhytologist223:385-396.

72.ZhaiW.,DuanX.,ZhangR.,GuoC.,LiL.,XuG.,ShanH.,KongH.*,RenY.*,2019.ChloroplastgenomicdataprovidenewandrobustinsightsintothephylogenyandevolutionoftheRanunculaceae.MolecularPhylogeneticsandEvolution135:12-21.

71.王宏哲,张睿,程劼,段晓姗,赵慧琪,山红艳,孔宏智*,2019.花基本结构的多样性及其分子机制.中国科学：生命科学49:292-300.

70.陈凡,钱前,王台,董爱武,漆小泉,左建儒,杨淑华,林荣呈,萧浪涛,顾红雅,陈之端,姜里文,白永飞,孔宏智,种康,2018.2017年中国植物科学若干领域重要研究进展.植物学报53:391-440.

69.ZhangL.,KongH.,MaH.,YangJ.*,2018.Phylogenomicdetectionandfunctionalpredictionofgenespotentiallyimportantforplantmeiosis.Gene643:83-97.

68.HarkessA.,ZhouJ.,XuC.,BowersJ.E.,VanderHulstR.,AyyampalayamS.,MercatiF.,RiccardiP.,McKainM.R.,KakranaA.,TangH.,RayJ.,GroenendijkJ.,ArikitS.,MathioniS.M.,NakanoM.,ShanH.,Telgmann-RauberA.,KannoA.,YueZ.,ChenH.,LiW.,ChenY.,XuX.,ZhangY.,LuoS.,ChenH.,GaoJ.,MaoZ.,PiresJ.C.,LuoM.,KudrnaD.,WingR.A.,MeyersB.C.,YiK.,KongH.,LavrijsenP.,SunseriF.,FalavignaA.,YeY.*,Leebens-MackJ.H.*,ChenG.*,2017.TheasparagusgenomeshedslightontheoriginandevolutionofayoungYchromosome.NatureCommunications8:1279.

67.KramerE.M.*,KongH.,RausherM.D.,2017.Plantevolutionarydevelopmentalbiology.Introductiontoaspecialissue.NewPhytologist216:335-336.

66.王小菁,萧浪涛,董爱武,王台,钱前,漆小泉,陈凡,左建儒,杨淑华,顾红雅,陈之端,姜里文,白永飞,孔宏智,种康,2017.2016年中国植物科学若干领域重要研究进展.植物学报52:394-452.

65.山红艳,孔宏智*,2017.花是如何起源的？科学通报62:2323-2334.

64.HuangJ.,LiZ.,BienerG.,XiongE.,MalikS.,EatonN.,ZhaoC.Z.,RaicuV.,KongH.,ZhaoD.*,2017.Carbonicanhydrasesfunctioninanthercelldifferentiationdownstreamofthereceptor-likekinaseEMS1.ThePlantCell29:1335-1356.

63.杨淑华,王台,钱前,王小菁,左建儒,顾红雅,姜里文,陈之端,白永飞,孔宏智,陈凡,萧浪涛,董爱武,种康,2016.2015年中国植物科学若干领域重要研究进展.植物学报51:416-472.

62.YeL.,WangB.,ZhangW.,ShanH.*,KongH.*,2016.Gainsandlossesofcis-regulatoryelementsledtodivergenceoftheArabidopsisAPETALA1andCAULIFLOWERduplicategenesinthetime,space,andlevelofexpressionandregulationofoneparalogbytheother.PlantPhysiology171:1055-1069.(CommentedbyGunterTheissenandFrancoisParcyatFloweringHighlights;recommendedbyF1000Prime:https://facultyopinions.com/prime/726292577;TopTopicsfrom2016ofPlantPhysiology)

61.YuX.,DuanX.,ZhangR.,FuX.,YeL.,KongH.,XuG.*,ShanH.*,2016.Prevalentexon-intronstructuralChangesintheAPETALA1/FRUITFULL,SEPALLATA,AGAMOUS-LIKE6,andFLOWERINGLOCUSCMADS-boxgenesubfamiliesprovidenewinsightsintotheirevolution.FrontiersinPlantScience7:598.

60.WangP.,LiaoH.,ZhangW.,YuX.,ZhangR.,ShanH.,DuanX.,YaoX.,KongH.*,2016.Flexibilityinthestructureofspiralflowersanditsunderlyingmechanisms.NaturePlants2:15188.(CommentedbyDouglasE.Soltis,2016.Diversificationoftheflower.NaturePlants2:15211.)

59.孔宏智*,2016.生物多样性事业呼唤对物种概念和物种划分标准的深度讨论.生物多样性24:977-978.

58.种康,王台,钱前,王小菁,左建儒,顾红雅,姜里文,陈之端,白永飞,杨淑华,孔宏智,陈凡,萧浪涛,2015.2014年中国植物科学若干领域重要研究进展.植物学报50:412-459.

57.LiL.,YuX.,GuoC.,DuanX.,ShanH.,ZhangR.,XuG.,KongH.*,2015.InteractionsamongproteinsoffloralMADS-boxgenesinNupharpumila(Nymphaeaceae)andthemostrecentcommonancestorofextantangiospermshelpunderstandtheunderlyingmechanismsoftheoriginoftheflower.JournalofSystematicsandEvolution53:285-296.

56.LiH.,MengF.,GuoC.,WangY.,XieX.,ZhuT.,ZhouS.,MaH.,ShanH.*,KongH.*,2014.MeioBase:acomprehensivedatabaseformeiosis.FrontiersinPlantScience5:728.

55.ZengL.,ZhangQ.,SunR.,KongH.,ZhangN.*,MaH.*,2014.Resolutionofdeepangiospermphylogenyusingconservednucleargenesandestimatesofearlydivergencetimes.NatureCommunications5:4956.

54.JiaR.,GuoC.,XuG.,ShanH.,KongH.*,2014.Evolutionofthecyclingenefamilyinplants.JournalofSystematicsandEvolution52:651-659.

53.袁明,瞿礼嘉,王小菁,钱前,杨维才,王台,孔宏智,蒋高明,种康,2014.2013年中国植物科学若干领域重要研究进展.植物学报49:347-406.

52.孔宏智*,2014.从基因组到多样性.生物多样性22:1-2.

51.张睿*,国春策,山红艳,孔宏智,2014.发育重塑与生物多样性.生物多样性22:66-71.

50.国春策*,张睿,山红艳,孔宏智,2014.调控进化与形态多样性.生物多样性22:72-79.

49.钱前,瞿礼嘉,袁明,王小菁,杨维才,王台,孔宏智,蒋高明,种康,2013.2012年中国植物科学若干领域重要研究进展.植物学报48:231-287.

48.AmborellaGenomeProject,2013.TheAmborellagenomeandtheevolutionoffloweringplants.Science342:1241089.

47.ZhangR.,GuoC.,ZhangW.,WangP.,LiL.,DuanX.,DuQ.,ZhaoL.,ShanH.,HodgesS.A.,KramerE.M.,RenY.*,KongH.*,2013.DisruptionofthepetalidentitygeneAPETALA3-3ishighlycorrelatedwithlossofpetalswithinthebuttercupfamily(Ranunculaceae).ProceedingsoftheNationalAcademyofSciencesUSA110:5074-5079.

46.KahloulS.,ElBejiI.H.S.,BoulaflousA.,FerchichiA.,KongH.,MouzeyarS.*,BouzidiM.F.,2013.Structural,expressionandinteractionanalysisofriceSKP1-likegenes.DNAResearch20:67-78.

45.瞿礼嘉,钱前,袁明,王小菁,杨维才,王台,孔宏智,蒋高明,种康,2012.2011年中国植物科学若干领域重要研究进展.植物学报47:309-356.

44.WangB.,ZhangN.,GuoC.,XuG.,KongH.,ShanH.*,2012.EvolutionarydivergenceoftheAPETALA1andCAULIFLOWERproteins.JournalofSystematicsandEvolution50:502-511.

43.孔宏智*,2012.生物多样性是如何产生的？生物多样性20:117-118.

42.XuG.,GuoC.,ShanH.,KongH.*,2012.Divergenceofduplicategenesinexon–intronstructure.ProceedingsoftheNationalAcademyofSciencesUSA109:1187-1192.

41.袁明,王小菁,钱前,杨维才,瞿礼嘉,王台,孔宏智,许亦农,蒋高明,种康,2011.2010年中国植物科学若干领域重要研究进展.植物学报46:233-275

40.LiuY.,GuoC.,XuG.,ShanH.,KongH.*,2011.Evolutionarypatternoftheregulatorynetworkforflowerdevelopment:insightsgainedfromacomparisonoftwoArabidopsisspecies.JournalofSystematicsandEvolution49:528-538.

39.ZhangQ.,AntonelliA.,FeildT.S.,KongH.*,2011.Revisitingtaxonomy,morphologicalevolution,andfossilcalibrationstrategiesinChloranthaceae.JournalofSystematicsandEvolution49:315-329.

38.SharmaB.,GuoC.,KongH.,KramerE.M.*,2011.Petal-specificsubfunctionalizationofanAPETALA3paralogintheRanunculalesanditsimplicationsforpetalevolution.NewPhytologist191:870-883.

37.李安,徐桂霞,孔宏智*,2011.F-box基因拷贝数目变异的机制研究：以12种果蝇为例.生物多样性19:3-16.

36.LiuC.,ZhangJ.,ZhangN.,ShanH.,SuK.,ZhangJ.,MengZ.,KongH.*,ChenZ.*,2010.InteractionsamongproteinsoffloralMADS-boxgenesinbasaleudicots:implicationsforevolutionoftheregulatorynetworkforflowerdevelopment.MolecularBiologyandEvolution27:1598-1611.

35.GaoX.,LiangW.,YinC.,Ji.S.,WangH.,SuX.,GuoC.,KongH.,XueH.,ZhangD.*,2010.TheSEPALLATA-LikegeneOsMADS34isrequiredforriceinflorescenceandspikeletdevelopment.PlantPhysiology153:728-740.

34.薛皓月,徐桂霞,国春策,山红艳,孔宏智*,2010.拟南芥和琴叶拟南芥中MADS-box基因的比较进化分析.生物多样性18:109-119.

33.LiH.,LiangW.,JiaR.,YinC.,ZongJ.,KongH.,ZhangD.*,2009.TheAGL6-likegeneOsMADS6regulatesfloralorganandmeristemidentitiesinrice.CellResearch20:299-313.

32.王台,钱前,袁明,王小菁,杨维才,瞿礼嘉,孔宏智,许亦农,蒋高明,种康,2010.2009年中国植物科学若干领域重要研究进展.植物学报45:265-306.

31.ShanH.,ZahnL.,GuindonS.,WallP.K.,KongH.,MaH.,dePamphilisC.W.,Leebens-MackJ.*,2009.EvolutionofplantMADS-boxtranscriptionfactors:evidenceforshiftsinselectionassociatedwithearlyangiospermdiversificationandconcertedgeneduplications.MolecularBiologyandEvolution26:2229-2244.

30.杨维才,瞿礼嘉,袁明,王小菁,王台,孔宏智,许亦农,蒋高明,种康,2009.2008年中国植物科学若干领域重要研究进展.植物学报44:379-409.

29.WangX.,KongH.,MaH.*,2009.F-boxproteinsregulateethylenesignalingandmore.Genes&Development23:391-396.

28.XuG.,MaH.,NeiM.*,KongH.*,2009.EvolutionofF-boxgenesinplants:differentmodesofsequencedivergenceandtheirrelationshipswithfunctionaldiversification.ProceedingsoftheNationalAcademyofSciencesUSA106:835-840.

27.瞿礼嘉,王小菁,王台,杨维才,许亦农,袁明,蒋高明,孔宏智,种康,2009.2007年中国植物科学若干领域重要研究进展.植物学报44:2-26.

26.SuK.,ZhaoS.,ShanH.,KongH.,LuW.,TheissenG.,ChenZ.*,MengZ.*,2008.TheMIKregionratherthantheC-terminaldomainofAP3-likeclassBfloralhomeoticproteinsdeterminesfunctionalspecificityinthedevelopmentandevolutionofpetals.NewPhytologist178:544-558.

25.QuanL.,XiaoR.,LiW.,OhS.-A.,KongH.,AmbroseJ.C.,MalcosJ.L.,CyrR.,TwellD.,MaH.*,2008.FunctionaldivergenceoftheduplicatedAtKIN14aandAtKIN14bgenes:criticalrolesinArabidopsismeiosisandgametophytedevelopment.ThePlantJournal53:1013-1026.

24.ZhuX.,ChaseM.W.,QiuY.,KongH.,DilcherD.L.,LiJ.,ChenZ.*,2007.MitochondrialmatRsequenceshelptoresolvedeepphylogeneticrelationshipsinrosids.BMCEvolutionaryBiology7:217.

23.ShanH.,ZhangN.,LiuC.,XuG.,ZhangJ.,ChenZ.*,KongH.*,2007.PatternsofgeneduplicationandfunctionaldiversificationduringtheevolutionoftheAP1/SQUAsubfamilyofplantMADS-boxgenes.MolecularPhylogeneticsandEvolution44:26-41.

22.XuG.,KongH.*,2007.DuplicationanddivergenceoffloralMADS-boxgenesingrasses:evidenceforthegenerationandmodificationofnovelregulators.JournalofIntegrativePlantBiology49:927-939.

21.种康,瞿礼嘉,袁明,王小菁,杨维才,王台,许亦农,蒋高明,孔宏智,2007.2006年中国植物科学若干领域重要研究进展.植物学通报24:253-271.

20.KongH.*,LandherrL.L.,FrohlichM.W.,Leebens-MackJ.,MaH.,dePamphilisC.W.*,2007.PatternsofgeneduplicationintheplantSKP1genefamilyinangiosperms:evidenceformultiplemechanismsofrapidgenebirth.ThePlantJournal50:873-885.

19.ShanH.,SuK.,LuW.,KongH.,ChenZ.*,MengZ.*,2006.ConservationanddivergenceofcandidateclassBgenesinAkebiatrifoliata(Lardizabalaceae).DevelopmentGenesandEvolution216:785-795.

18.LinZ.,KongH.,NeiM.*,MaH.*,2006.OriginsandevolutionoftherecA/RAD51genefamily:Evidenceforancientgeneduplicationandendosymbioticgenetransfer.ProceedingsoftheNationalAcademyofSciencesUSA103:10328-10333.

17.KimS.*,KohJ.,YooM.-J.,KongH.,HuY.,MaH.,SoltisP.S.,SoltisD.E.*,2005.ExpressionoffloralMADS-boxgenesinbasalangiosperms:Implicationfortheevolutionoffloralregulators.ThePlantJournal43:724-744.

16.LiG.,MengZ.*,KongH.,ChenZ.,TheissenG.,LuA.*,2005.CharacterizationofcandidateclassA,BandEfloralhomeoticgenesfromtheperianthlessbasalangiospermChloranthusspicatus(Chloranthaceae).DevelopmentGenesandEvolution215:437-449.

15.ZahnL.M.,KongH.(equalcontribution),Leebens-MackJ.H.,KimS.,SoltisP.S.,LandherrL.L.,SoltisD.E.,dePamphilisC.W.,MaH.*,2005.TheEvolutionoftheSEPALLATAsubfamilyofMADS-boxgenes:Apre-angiospermoriginwithmultipleduplicationsthroughoutangiospermhistory.Genetics169:2209-2223.

14.WangG.,KongH.(equalcontribution),SunY.,ZhangX.,ZhangW.,AltmanN.,dePamphilisC.W.,MaH.*,2004.Genome-wideanalysisofthecyclinfamilyinArabidopsisandcomparativephylogeneticanalysisofplantcyclin-likeproteins.PlantPhysiology135:1084-1099.

13.KongH.,Leebens-MackJ.,NiW.,dePamphilisC.W.,MaH.*,2004.HighlyheterogeneousratesofevolutionintheSKP1genefamilyinplantsandanimals:functionalandevolutionaryimplications.MolecularBiologyandEvolution21:117-128.

12.LiG.,MengZ.*,KongH.,ChenZ.,LuA.*,2003.ABCmodelandfloralevolution.ChineseScienceBulletin48:2415-2421(inChinese);48:2651-2657(inEnglish)

11.ZhangF.,KongH.,GeS.*,2003.AllozymevariationandpopulationdifferentiationoftheAconitumdelavayicomplex(Ranunculaceae)intheHengduanMountainsofChina.BiochemicalGenetics41:47-55.

10.KongH.*,LuA.,EndressP.K.,2002.FloralorganogenesisofChloranthussessilifolius,withspecialemphasisonthemorphologicalnatureoftheandroeciumofChloranthus(Chloranthaceae).PlantSystematicsandEvolution232:181-188.

09.KongH.*,ChenZ.,LuA.,2002.PhylogenyofChloranthus(Chloranthaceae)basedonnuclearribosomalITSandplastidtrnL-Fsequencedata.AmericanJournalofBotany89:940-946.

08.刘建全,何亚平,孔宏智,2002.大吴风草属、假橐吾属花粉表面纹饰及其分类学意义.西北植物学报22:33-36.

07.KongH.*,2001.ComparativemorphologyofleafepidermisintheChloranthaceae.BotanicalJournaloftheLinneanSociety136:279-294.

06.KongH.,2000.TaxonomicnotesonChloranthushenryiHemsl.anditsallies.ActaPhytotaxonomicaSinica38:355-365.

05.钱韦*,孔宏智,刘忠,杨冬之,2000.评统一进化理论——与陈继明先生商榷.科学通报45:885-889.

04.KongH.,ChenZ.,2000.PhylogenyinChloranthusSwartz(Chloranthaceae)inferredfromsequenceanalysisofnrDNAITSregion.ActaBotanicaSinica42:762-764.

03.KongH.*,2000.KaryotypesofSarcandraGardn.andChloranthusSwartz(Chloranthaceae)fromChina.BotanicalJournaloftheLinneanSociety133:327-342.

02.KongH.*,LiuJ.,1999.KaryomorphologyofthegenusPomatosaceMaxim.(Primulaceae).ActaPhytotaxonomicaSinica37:445-450.

01.KongH.,YangQ.*,1997.KaryomorphologyandrelationshipsofthegenusCircaeasterMaxim.ActaPhytotaxonomicaSinica35:494-499.

专著（注*为通讯作者）

01.SoltisD.E.*,AlbertV.A.,KimS.,YooM.J.,SoltisP.S.,FrohlichM.W.,Leebens-MackJ.,KongH.,WallK.,dePamphilisC.W.,MaH.,2005.EvolutionoftheFlower.InPlantDiversityandEvolution:GenotypicandPhenotypicVariationinHigherPlants,Ed.HenryR.J..CABIPublisherspp.165-200.