博尔济吉特哲哲,生于明万历二十七年四月十九日(1599年5月13日),是科尔沁贝勒莽古思的女儿,当时的皇太极势力越发的强盛,莽古思为了拉宠皇太极,便将自己的女儿哲哲嫁给皇太极,很明显这是一场政治婚姻,完全出于对部落的守护,当时的哲哲只有16岁,皇太极比哲哲大七岁,经过双方协商,订在万历四十二年(1614年)四月二十日完婚,这是皇太极娶的第一个科尔沁蒙古妻子。
从小生活在科尔沁大草原上的哲哲,自然与满族的女子不同,她们更是豪迈,再加上哲哲长得端庄贤淑,嫁家势力支撑,皇太极对哲哲也是恩爱有加,夫妻两人关系很好,天命十年(1625年)八月初九日,哲哲为皇太极生下了一个女儿,是为皇二女,虽然是个女孩子,皇太极对哲哲也是十分宠爱,以表她的辛苦,皇太极继汗位后,便立哲哲为大妃,让其管理后宫之事,没过两年哲哲又怀孕了,天聪二年(1628年)七月初三日,哲哲又生下了一个女儿,天聪八年(1634年)哲哲再次生一女婴,连生三女的哲哲心灰意冷,皇太极也有所失望。
为再次笼络皇太极,哲哲的娘家人说服哲哲让大玉儿,也就是她的亲侄女入宫,与亲侄女共侍一夫的哲哲当然心有不甘,但为了家族部落,她愿意这样做,很快娘家的两位侄女海兰珠、大玉儿接连嫁给了皇太极,并且深受恩宠,姑侄三人将后宫打理的井井有条,使得科尔沁在皇太极心中的地位也更是稳固,天聪十年(1636年)四月十一日皇太极称帝,建国号“大清”,并建五宫,哲哲为清宁宫皇后,并于七月十日举行大清国首次皇后册立礼,她成为了大清国第一位名副其实的皇后。
崇德八年(1634年)八月九日,皇太极在清宁宫驾崩,哲哲拥立自己的亲侄女庄妃年仅6岁的儿子福临继承皇位,八月二十六日于沈阳皇宫登基帝位,此时的哲哲权利达到顶峰时期,顺治六年(1649年)四月十七日,哲哲因病长逝,顺治七年(1650年)二月初五,哲哲的梓宫火化后放于皇太极旁,康熙二年(1663年)与皇太极的宝宫正式葬入地宫。