襄阳之战后南宋士气大跌，但其高层的腐败和逃避政策注定最终灭亡
宋元之战与蒙灭西夏之战和蒙金战争不同的地方就是在与蒙古对南宋曾因中间内乱与南宋时战时和， 而蒙古骑兵也并没有像对西夏一样在南宋长江淮河边疆一带进行不断地洗劫或袭掠。
战争分为三次大战， 分别是窝阔台攻宋之战、 蒙哥攻宋之战、忽必烈南征灭宋。 其中每场战争又分为几次小战争。 窝阔台攻宋之战从端平二年（1235年）至淳祐元年（1241年），包括沔州之战、真州之战、阳平关之战、庐州之战、京襄之战；蒙哥攻宋之战从宝祐元年（1253年）至开庆元年（1259年），包括蒙古攻四川之战、鄂州之战、钓鱼城之战，忽必烈南征灭宋从咸淳四年（1268年）至祥兴二年（1279年），包括襄、樊之战。
其中，真州之战是发生在端平三年（1236年）十一月， 宗王率领军队进攻宋淮西地区。之后直到蒙古军再次进攻，宋伏兵突起，炮石俱发，将他们击退。丘岳继遣勇士袭击蒙古军的营垒，焚烧他们的庐帐，于是蒙古军被迫撤围退走。
之后在宝祐元年（1253年）至开庆元年（1259年）间，在南宋宝祐六年（1258年）到开庆元年（1259年）间，在蒙哥攻宋之战中， 宋将王坚以及副将张珏扼守钓鱼城， 抵抗蒙古军进攻的著名要塞防御战， 这场战争就是著名的钓鱼城之战。 这场战争的结果是蒙古军遂撤围北还。
蒙元统一示意图
第三次战役忽必烈南征灭宋中也有一次小战，称之为襄、樊之战。最后一次战争历时12年之久，由于忽必烈的攻宋方略的正确，善于选择伯颜等良将，并且注重发展水军和大力实行招降安抚政策，最后形成了军事、政治的优势，逼迫宋军到了被迫挨打的境地，最后终于灭亡了南宋， 统一了中国。
其中襄樊之战可谓是南宋灭亡的转折点。是决定南宋命运的关键一战。
历史上襄樊战役的惨烈程度，就是机械化战争时代的列宁格勒围困、和斯大林格勒鏖战都难以望其项背，据说战役结束后60年，襄樊城的人口才恢复到战前的水平，而后来的襄樊人其实都是湖广两省的移民，战前的襄樊人根本没有幸存下来的。从端平二年（1235年）开始宋蒙之间的军事同盟破裂之后在襄阳开战以来，一直到咸淳九年（1273年）襄阳守将吕文焕投降元朝，前后历时长达38年。在这段时间内，共中间经历了襄阳城的失守与收复、再失守与再收复、蒙古南宋各自的内乱甚至内战、双方尔虞我诈的谈判、打打停停的消耗各种事端是层出不穷。宋蒙（元）双方为了争夺这个历来被称为兵家必争之地的水路交通要塞，几乎集中了当时世界上最精锐的骑兵和水军，动用了当时能找到的一切先进武器，双方死伤人数超过40万人。的地位。
襄阳之战对元宋双方都具有重要意义。胜利的一方发现南宋朝廷的腐朽没落已经不可救药，从中看到灭宋的希望，而失败的一方不仅沿长江一线及以南的防守从此处于极其被动的势态，而且民心士气大受挫折，南宋王朝灭亡的丧钟已经清晰可闻。
元军占领襄阳后，又于当年攻下鄂州。 京城太学生和群臣上疏，一致要贾似道亲自督师抗元。贾似道迫不得已，只好在临安设立都督府，但他迟迟不敢与元军对决。直到德祐元年（1275年）正月，鄂州失陷以后，他才抽调各路精兵13万，从水路出发。他带了大批辎重，船只首尾相接达百余里。途经安吉（今浙江安吉北），他的座船因过于庞大，在拦河坝上搁浅，水军只得为他换船继续前进。 队伍开到芜湖（今安徽芜湖），贾似道就迫不及待地与元朝联系议和， 他从芜湖放回元朝俘虏，并送荔枝、黄柑给元朝丞相伯颜，同时派使者去元军大营，请求称臣送岁币。伯颜拒绝议和，并继续进兵至安庆（今安徽安庆）、池州（今安徽贵池）、丁家洲（今安徽铜陵东北长江中）一战，宋军前锋毫无斗志，不战而走，后方督战的贾似道也惊慌逃窜。
此一役，宋军主力大部分被歼，士气丧失殆尽。贾似道兵败之后， 元军主力顺长江东下， 很快逼近临安， 赵宋王朝已处在灭亡的前夕。贾似道丧师辱国，朝野震动，群情激愤，太学生及台谏、侍从官纷纷上疏请杀贾似道，在朝臣的强烈要求下，谢太后只得将贾似道贬为高州（今广东高州东北）团练使，并派人监押。绍兴府有个小吏郑虎臣，因受过贾似道迫害，为了报仇，他主动要求担任押送官。郑虎臣一路上羞辱贾似道，不时找机会欲置贾似道于死地。走到漳州，郑虎臣横下心来，在贾似道如厕时结果了他的性命。
伯颜
德祐二年（1276年）正月，元丞相伯颜率领的元军云集临安城下，谢太后欲战不胜、南渡无法脱身，她任命文天祥为右丞相兼枢密使，与元军接洽。然而，文天祥前往元营和谈时却被伯颜扣留。谢太后无奈，只得向伯颜奉上传国宝玺和降表，开城投降。南宋主体政权已经灭亡，5岁的南宋皇帝恭宗赵㬎被俘，后送西藏为僧。至元二十五年（1288年）十月，瀛国公赵㬎已有十八岁了，元世祖下诏，派遣赵㬎入吐蕃，学习梵书、西蕃字经。元代高僧释念常所著《佛祖通载》记载：“宋主以王位来归，学佛修行。帝大悦，命削发为僧宝焉。”赵㬎十九岁到西藏喇嘛庙里出家，得法号“合尊”，此后为了忘却曾经伤心事，潜心学习藏文，果然皇天不负有心人，何况赵家的人就是带着这种遗传的文化素养。不数年，赵㬎已经在藏佛界暂露头角，成为把汉文佛典译成藏文的翻译家，并且还担任过萨迦大寺的总持，成为当时西藏的佛学大师，四处讲经、潜心研究佛学，一生如此。后来翻译了《百法明门论》，还有深奥的《因明入正理论》，在扉页留下了题字，自称“大汉王出家僧人合尊法宝”，被藏族史学家列入翻译大师的名单。成为一段历史奇事。赵㬎的结局只在《佛祖历代通载》汉文版里提了一句：“至治三年四月，赐瀛国公合尊死于河西，诏僧儒金书藏经。”到元英宗至治三年（1323年），宋恭帝才结束他作为喇嘛的生活，也结束了他47年的俘虏生活，这一年他52岁了。算起来他在西藏定居了34年，其间再也没有踏入中原和那思牵梦绕的江南故乡！
此时的南宋全境已纳入元朝版图，但是南宋残余势力陆秀夫、文天祥和张世杰等人连续拥立了两个幼小的皇帝（端宗、幼主），成立小朝廷，元军对小皇帝穷追不舍，不断逃亡至南方，在元军追击中受惊，端宗因病驾崩，不得不另立幼主，逃至新会至南海一带。文天祥在海丰兵败被俘，张世杰战船沉没，走投无路的南宋残余势力终于在至元十六年二月初六（1279年3月19日）随着崖山海战失败及陆秀夫负刚满8岁的小皇帝跳海而死而彻底灭亡，四十八年与蒙的抗衡完结。宋室在南方153年的统治宣告终结。而赵宋宗室在中国319年的统治一去不返，无法光复。
崖山之战的惨烈
德祐二年（1276年），蒙元雄师包抄南宋行在临安，太皇太后谢氏自知无力回天，便以恭帝的名义向敌军统帅伯颜投降，至此，宋朝在实际上已经灭亡。但与此同时，不愿降敌的大臣们以丞相文天祥、陈宜中、陆秀夫及大将张世杰为首，先后拥立益王赵昰、广王赵昺为帝，并在闽粤一带抗击元军，但在对方的猛攻下，却只能接连败退。祥兴二年（1279年）仲春，流亡到崖山的南宋小朝廷迎来最后一战。
战役开始前，面临不利的局面，有幕僚向主帅张世杰建议，应该先行占据海湾的出海口，以便战事万一失利，可保护残余舰船向西撤退。然而张世杰考虑到一旦这样做，被元军吓破胆的士兵可能会就此逃亡，所以坚拒此议。为了跟元军破釜沉舟，张世杰下令将陆地上的建筑物全部焚毁，又下令将全部船只用铁索连接在一起，以增强步履的不乱性，并将小天子赵昺的龙舟放在戎行中间。
仲春初六（3月19日），面临着愈发不利的局面，张世杰只能冒死出击，但愿能杀出一条血路。元军多是骁勇善战之人，等到两军一接触，便在箭雨的掩护下猛攻对手，夺走敌船七艘，一路直扑宋军正中心。从中午到傍晚，海战进行得异常激烈。突然，张世杰见到一条宋船降下了旗帜，休止了抵挡，其他战船也纷纷效仿，自知大势已去，便率十余只船舰斩断大索突围而去。
陆秀夫和赵昺
主帅既已逃遁，宋军便形同“无头苍蝇”，只剩下被屠戮的份儿。此时，左丞相陆秀夫在龙舟上护卫小天子，见此时敌船徐徐迫临，自知已无出逃可能，为避免被俘后受辱，便决意挽劝小天子殉国（此前，文天祥已在江西被俘，陈宜中逃至海外）。陆秀夫首前驱使自己的妻子、儿女投海自尽，随即将玉玺系在腰间，背起八岁的赵昺奋身跃入大海，就此以身殉国。
在听闻天子投海殉国的噩耗后，其他船上的大臣、宫眷、将士顿时哭声震天。在此失望时刻，追随小朝廷的十余万军民，由于不愿遭受蒙元的凌辱，便接踵跳海自杀，以最激烈的方式，来表明自己誓不做亡国奴的意志，其场面之悲壮，真可谓“天地同悲，日月同泣”。史载：“陆秀夫走卫王舟，王舟大，且诸舟环结，度不得出走，乃负昺投海中，后宫及诸臣多从死者，七日，浮尸出于海十余万人。”
张世杰逃出包抄圈时，把小天子的养母、皇太后杨氏带在身边，但愿小天子万一遭遇不测后，还能侍奉太后继承寻找皇室之后，以图再举。然而等到杨太后听闻赵昺的死讯后，却是万念俱灰，对随从们说：“
我为赵氏，亦已至矣，一君亡，复立一君，今又亡。我未死者，庶几敌兵退，别立赵氏以存祀耳。今若此，岂天意耶！”随即，杨太后也投海自尽。张世杰在草草掩埋杨太后之后，随即也投海殉国（一说为遭遇风暴而落水溺死）。
赵昀和其头骨做成的酒器
蒙古灭宋后，忽必烈命西藏大喇嘛杨琏真迦管理江南佛教的大小事务，为了防止百姓对前朝的思念，于是他们对绍兴的宋帝陵墓大肆破坏。杨琏真伽盗掘了6座宋帝陵墓，其中宋理宗赵昀的尸体泡在水银中，保存完好，安卧似睡，当时的水银很珍贵，再加上众多宝物，杨琏真迦怎会轻易放过，于是他命人将宋理宗尸体倒挂在墓旁的一根树枝上，以沥取腹内水银。水银沥干后，后又发现宋理宗的头颅大如斗，于是他随即割下，刮掉皮肉，将颅骨一剖两半，镶银涂漆，做成了“酒碗”法器。他认为皇帝头骨制成的法器，可以厌胜，还可以带来好运，于是随身携带，视为珍宝。
之后人骨酒碗送给了元朝皇室，一直在元廷权贵阶层手中流传，直到元朝灭亡。后来还是朱元璋得知了宋理宗头骨酒碗的下落，用高价从西域僧人汝纳处买了回来，并且在洪武二年（1369年）举行了隆重的仪式迎回宋理宗头骨，以帝王的规格埋葬在了南京，同时下令修复宋六陵。洪武三年（1370年），将宋理宗头骨移到永穆陵安葬。历经这么多年的时间，宋理宗的头骨终于回到原地！
灭亡的原因
南宋的政治和军事形势留给后人更多的是苟且、 软弱和无可奈何！分析南宋的经济实力和军事装备会发现，南宋并不是一个不堪一击、积贫积弱的王朝。宋朝在行政制度、经济运行和火药火器技术的研究等方面都超过汉唐。南宋朝廷以雄厚的江南经济做后盾，推行“以金钱换和平”的外交策略，似乎也无可厚非。
不幸的是，两宋政权一直处于诸多勃兴的少数民族政权的夹击和围攻之中，穷于应付战局， 实属无奈！契丹、党项、女真和蒙古族在十至十三世纪相继崛起，其势难以抵挡，也在情理之中。两宋朝廷本无意消灭这些敌对政权，攻击力虽不甚锐利，但抵御来犯之敌的能力尚且有余，在面对蒙古族大军的时候尤其如此。从开禧二年（1206年）开始，蒙古族大军几乎是以排山倒海之势相继灭金、灭西夏、灭花剌子模、灭俄罗斯诸公国、败波兰等东欧国家，独独在吞并南宋的战争中，无论是出动的兵力，还是相持的时间，损失之惨痛，都是前所未有的。蒙古从端平二年（1235年）举兵伐宋，到祥兴二年（1279年）彻底摧毁宋王室，历时近半个世纪之久，恐怕是蒙古的这些大汗们始料不及的。
南宋灭亡的真正原因在于统治者上层出现了严重的问题，朝政上吏治腐败， 使得民不聊生。像贾似道在元军大举攻宋的时候，作为前线指挥，他一面封锁军情，一面向敌人称臣请降，这种两面派的作风是无法长久的。君臣上下，不思进取，既没有北定中原的雄心，也没有积极防御的打算，只是一味搜括民脂民膏，贪恋奢华的生活，所谓“暖风熏得游人醉，直把杭州作汴州”就是形象的写照。