漕运总督设立的原因（为什么设立漕运总督这一职位）
说起淮安，也算是历史名城，曾是漕运枢纽、盐运要冲，有“中国运河之都”的美誉。
淮安地理优势
公元前486年，吴王夫差，开挖中国大运河最早开凿河段——邗沟（即京杭大运河的扬州至楚州段），沟通长江、淮河。
故成为春秋战国各诸候国，争夺的重要地区，先后为吴、越、楚国所有。
秦统一六国后，推行郡县制。市境分属泗水郡和东海郡，始置县邑，有淮阴、盱眙、东阳。
淮安已经有悠久的历史，到了明朝，淮安府，辖山阳、清河、安东、盐城、桃源、宿迁、沭阳、睢宁、赣榆、邳州、海州，计九县两州，范围包括今苏北绝大部分地区。
其间，还有漕运总督、南河总督（清朝设立，负责江苏河道的疏浚及堤防），驻节淮安。
其行政地位很高，虽然淮安只是一个市，总督却可以管几个巡抚，相当于现在的直辖市低一个等级。
漕运总督，是明朝中央政府派出的统管全国漕运事务的高级官员，品级为从一品或正二品。
还经常兼巡抚江淮，节制淮安、扬州、庐州、凤阳四府及徐州、滁州、和州三州，管辖范围包括今江苏、安徽二省的长江以北很大的范围。
为什么设立漕运总督府？因为朱棣迁都北京，保护粮食安全运输
明朝朱元璋时期，京城是在南京，北方漕务不忙，规模较小。
朱棣做了皇帝后，拟迁都北京，因为天下财富和粮食多出在南方，要将南方的粮食和其它物资，转运到北京。
就是“运输皇粮”，朝庭组织官员从涉河省份征收粮食，再沿大运河运送到交易枢纽目的地——北京通州。
自永乐二年（1404），始设漕运总兵官，率12万军队，专门负责漕运。
1451年，改设立文职的漕运总督。
当时，古代运河的一项主要功能，就是政府来转运粮食，以满足国家正常的行政开支和百姓消费，这就是漕运。
京杭大运河，是明朝经济流通和统治赖以维系的交通生命线。为了确保这条千里长的京杭大运河的畅通无阻，保证北京城百万人口生存所需物资，历代皇帝几乎是不计成本，从政治、经济、军事等方面给以保障。
为此，明朝就专门设置了，直属中央的京杭大运河的地方管理机构——漕运总督。
将总督府设在淮安
那是因为，大明的第一任漕运总督（当时叫总兵官），平江伯陈瑄(1365—1433)，
陈瑄，总管漕运30年，为明清漕运奠定了基础，于宣德八年（1433）卒于淮安任所。接任漕运总兵官者，多为开国功臣的后裔，他们世袭侯爵或者伯爵。陈瑄一家就有4人先后担任过这一职务，他们是陈瑄自己和他的曾孙陈锐、玄孙陈熊、六代孙陈王谟。
思考的非常细致全面。淮安，地处于京杭大运河的中段，而漕运总督虽然节制长江、黄河、大运河三个水系，但是其所管理的长江和黄河河段，只包括和大运河发生联系的一段水域，而不是整条长江，整条黄河。
所以，如果从地图上看地理位置，淮安基本上位于总督府管辖地区的中间，也是正中心，如果从淮安发布一道命令出去，到其所辖区域的时间，基本上是差不多的，最远的就是湖广和河南一带，传递消息，一般十天之内就能到达。
所以，因为地理位置的缘故，当初陈瑄才会依据皇帝的旨意，将衙门设在淮安。
总督府，就坐落在淮安城的正中心，当初陈瑄出任第一任总督，那可是天下钱粮集散地，那可是一品大员，本身就是有爵位的勋贵，远远不是淮安府的府衙和五品知府能比的。
所以跟其他的城市不同，淮安府的知府府衙，反而是坐落在总督府边上的一个犄角旮旯，而总督府却是在淮安的正中。
按明朝惯例，镇守淮安的漕运总督，级别特高，多是由明代开国勋爵大臣的后裔担任的，他们承袭了父祖的勋爵，为伯为侯。可以称之为“超品”，即在九品十八级之上，远远高于同理漕政的文臣。
总督府的没落
明朝末年，局势动荡不安，外有后金犯边，内有农民大规模起义，朝庭内部东林党官员结党营私，大肆腐败，地方政权掠夺了漕运总督职权，而总督府也因为没有经费维持，变得愈发的破败了。
只不过作为文官集团的淮安府衙，倒是显得熠熠生辉，权力愈发盖过了总督府。
最后，到了清朝的时候，黄河在咸丰五年（1855年）北移至山东境内，夺大清河入海，京杭运河航道受阻，内河漕运意义不大，漕运总督和河道总督也失去了存在的意义。
江南河道总督在黄河改道后第三年（1858年）即被裁撤，漕运总督也在光绪三十一年（1905年）被裁撤。