朱允炆后裔到成化年间依然在世，但随后并无其有子嗣的记载
长子朱文奎
根据《明实录》和《明史》，朱允炆有据可查的子嗣共有两人，分别是皇太子朱文奎和建庶人朱文圭。
朱文奎，生于洪武二十九年（1396年）十月三十日，生母为皇太孙妃马氏。他是明朝历史上空前绝后的一位老皇帝在世时出生的皇曾孙。据说朱元璋竟然对曾长孙出生还很不满，认为晦气，《明太祖实录》记载：“甲寅，皇曾孙文奎生，皇太孙允炆长子也。上曰：‘十月，数之终，又生于晦日。’命内庭勿贺。”这个只怕是朱棣篡位后修改《太祖实录》，为了恶心大哥朱标才这样说的吧。
所谓的“晦日”是指中国农历每月的最后一天，即大月的三十日，小月的二十九日。但是从已知资料来看，似乎也查不到“晦日”到底有什么不好的意义。所以朱元璋的这段话，大概率是造假。
朱允炆即位后，于建文元年（1399年）二月册封朱文奎为皇太子。南京城破的当天，年仅七岁的皇太子朱文奎下落不明。《明史》记载：“燕师入，七岁矣，莫知所终。”
次子朱文圭
朱文圭，生于建文三年（1401年）十二月，生母为已经由皇太孙妃进封皇后的马氏。南京城破之后，年仅两岁的朱文圭被留在了皇宫内，如何处置这个幼童，成了困扰朱棣的难题。最终朱棣将其送到老家凤阳，幽禁于广安宫中，称为“建庶人”。《明史》记载：“年二岁，成祖入，幽之中都广安宫，号为建庶人。”
朱文圭
建庶人的命运极为凄惨，以他南京城破时两岁的年纪来看，对于其父皇和母后应该是毫无记忆的。而在此后的55年时间里，他的人生就一直在那座小小的广安宫中度过，这一方天地，竟然就是全部。
景泰八年（1457年）正月十七日凌晨，明英宗朱祁镇从紫禁城外的南宫中发动政变，将皇位从弟弟朱祁钰手中重新夺了回来。复辟之后的明英宗杀害景泰朝大臣、著名的民族英雄于谦，废弟弟仍为郕王，改景泰八年为天顺元年，并在弟弟死后赐恶谥“戾”。
朝局基本稳定之后，朱祁镇想起来要改善一下自己本就颇为不堪的口碑，想来想去，这位曾经的俘虏皇帝想起了“同为天涯沦落人”的朱文圭。释放早已不足为患的建文帝之子，无疑是个一本万利的好方法。《天顺日录》记载：“上复位之后，因思建庶人辈无辜淹禁将五、六十年，意欲宽之。一日，谓贤曰：‘亲亲之意，实所不忍。’贤即对曰：‘陛下此一念，天地鬼神实临之，太祖在天之灵实临之，尧、舜存心不过如此。’上遂决。即日白太后，许之。左右或以为不可，上曰：‘有天命者，任自为之。’左右闻之，皆愧服不能止。”
引文中的“贤”，即《天顺日录》的作者李贤。英宗复辟后，李贤是内阁大学士，他和皇帝之间的对话记录，可信度极高。最终建庶人离开广安宫这一方小小的天地，居住到了凤阳城中。朝廷每月提供“廪饩（即粮食之类生活物资）”，并且允许朱文圭“于军民之家自择婚配”，目的是“以续其后”。
《明史》上说朱文圭在被释放后“未几卒”，这个是明显的错误。“未几”这个词语，意思就是泛指没有多久。但事实上这位建庶人在获得自由之后，至少还活了十年。
朱见深
《明宪宗实录》记载：成化三年（1467年），“庚戌，巡抚淮扬、右副都御史胜昭言：建庶人、吴庶人等俱置凤阳城中，官军巡护警拆，声闻陵寝，恐或未安。况城池不修，或有不逞之徒一时事出不测，猝难防御。”“建、吴二庶人送置有军卫城池处，或凤阳旧中书省，严加防范。庶亲亲之意不失，而防守之虑亦严。”最终宪宗以“安置已定”的理由否决了这项提案，但至少说明在被释放十年之后，朱文圭依然在世。
至于以57岁高龄才得以婚配的建庶人有没有子嗣呢？从此后的实录记载来看，没有一个字提到，想来是没有的。按照正常结论，建文帝的血脉至此而绝。