高琼其实出身在一个官宦之家,在契丹出使南唐时他的家族被卷入了南唐朝廷的阴谋,祖父和父亲先后被杀,而高琼虽然保住了性命但也被监视起来。在这样的生活环境中高琼养成了好勇斗狠的性格,渐渐长大的高琼摆脱了监视成为了一名强盗,然而很快他被官府剿灭还被判处了死刑。然而让人没有想到的是就在他即将要被处斩的前一天高琼从狱中逃出,他一路跑到后周,投靠在了后周大将王审琦的麾下。
后来赵匡胤取代后周建立大宋朝时高琼也投靠了赵匡胤,在京兆尹赵光义的身边做了一名贴身护卫,后来在公元976年赵光义登基,高琼也成为了御龙直指挥使负责统领禁军。在之后的时间中高琼也立下很多战功,他在986年带兵北伐攻克秦皇岛、锦州等战略要地,在之后辽国萧太后亲自带兵攻打宋朝时高琼再度临危受命击退了辽国的进军。高琼也成为三军统帅。而高琼声望这高的一仗是在1004年,当时辽国萧太后与辽圣宗再度领二十万辽兵南下攻宋,众多宋朝官员主张南迁,而只有高琼与寇准建议宋真宗亲征,最终经过二人的力劝宋真宗下定了亲征的决心。宋真宗的亲征很大程度地激励了宋朝的将士。战场上高琼率军杀死辽国先锋萧达揽,迫使辽军罢兵立约,史称“澶渊之盟”。在此之后宋辽两个一百多年中没有发生过太大的战事。
公元1006年76岁的高琼病逝,死后他被追赠侍中、太师,之后又追封卫国武烈王,宋朝为他修庙祭祀供百姓祭拜。