董卓集团分为三大派系：帮助其篡夺朝政，也带来杀身之祸！
西凉军
首先，西凉军可以说是董卓集团的第一大派系，也是董卓的嫡系部队。董卓成长于凉州，喜欢结交羌人。汉桓帝末年，董卓被征召为羽林郎，后又在护匈奴中郎将张奂部下任军司马，讨伐汉阳羌人，作战粗猛有谋，屡建战功。
董卓长期在凉州一带作战，所以其部下也是以凉州人士为主。对于凉州军来说，代表人物包括牛辅、段煨、董越、李傕、郭汜、贾诩、张济、张绣、胡轸、华雄等。董卓来到洛阳后，正是依靠西凉军控制了朝政。为此，董卓也会拉拢其他将领和名士，甚至册封官职。不过，董卓集团的兵权还是被西凉人士牢牢掌握。
特别是在曹操、袁绍、袁术、孙坚等关东诸侯起兵讨伐的时候，董卓也是让凉州人率军前去抵抗。比如在阳人之战中，董卓派遣胡轸、吕布进攻孙坚，在这两人中，主帅就是西凉军的胡轸。等到董卓挟持汉献帝，并撤退到长安后，也是由凉州人率领军队驻扎在河东、弘农一带，成为拱卫长安的屏障。
并州军
公元189年，汉灵帝去世后，大将军何进和宦官火拼。为此，何进征召并州刺史丁原前来。等到何进和宦官两败俱伤后，董卓趁机控制了朝政。为了吞并并州军，董卓引诱吕布诛杀了并州刺史丁原。由此，吕布、张辽、李肃等并州人士也成为董卓的部下。
不过，和西凉军比起来，董卓显然不够信任并州军。在地位上，并州军也要低于凉州军。而就凉州军，也不满意并州军来分一杯羹。所以，在抵抗关东诸侯的时候，吕布故意给胡轸使坏，导致华雄被孙坚斩杀，这凸显了西凉军和并州军之间的矛盾。等到董卓迁都长安后，逐渐不像过去一样恩宠吕布等并州军，这成为吕布之后选择背叛的原因之一。
洛阳中军
相对于西凉军和并州军，洛阳中军在董卓集团的存在感相对较低。汉灵帝在位时，洛阳的兵马分为两个部分，一个是大将军何进所掌握的禁军，另一个则是宦官蹇硕掌握的西园军。汉灵帝去世后，何进火并掉蹇硕，又得到西园军的支持，也即何进全面掌握了洛阳中军。但是，在宦官的反击下，何进、何苗等人被杀，而曹操、袁绍、袁术、淳于琼等西园八校尉也逃出洛阳。
一时间，洛阳中军群龙无首，这是董卓可以迅速掌握洛阳城中兵马的重要原因。不过，和并州军一样，洛阳中军同样得不到董卓的信任。特别是来自于洛阳中军的伍孚、郑泰、荀攸等人，更是策划了刺杀董卓的行动。当然，行动没有成功，也加深了董卓对于洛阳中军的怀疑。
派系斗争，董卓被杀
公元190年，面对关东诸侯的讨伐，董卓迁都长安。诚然，关东诸侯因为貌合神离，勾心斗角，所以很快就解散了。可是，董卓集团的内部问题也随之爆发了。彼时，董卓自知自己凶暴，为人所恶，所以时常要吕布作自己的侍卫及守中阁；不过，董卓性格又十分猜疑，曾因少许失意而向吕布掷出手戟，由于吕布又与董卓的婢女有染，恐怕事情被董卓发觉，所以心中十分不安。
与此同时，王允正和士孙瑞、杨瓒等密谋除掉董卓，因此便让吕布作内应。吕布有些犹豫，说：“奈何是父子，怎么好下手呢？”王允说：“将军姓吕，本来就非亲生骨肉，如今你保全自己的性命还来不及，还说什么父子！”于是吕布答应了王允，成功刺杀董卓，任职奋武将军，假节，仪比三司，进封温侯，与王允同掌朝政。
对此，在笔者看来，这一次刺杀董卓的行动，可以说是并州军和洛阳中军的联合反击。不过，虽然董卓被杀后，但是，西凉军依然实力强大。在李傕、郭汜等人的率领下，西凉军反攻长安，击败了并州军和洛阳中军，从而继续挟持汉献帝刘协。