全盛时期能占领半壁江山的太平天国，为何最终以惨败收场？
首先，是由于其内部矛盾。而内部矛盾，又可以分为起义军首领之间的矛盾，以及通知集团和普通起义者之间的矛盾。
关于其内部矛盾，是由于统治集团内部争夺权力造成的，而原因则是由于起义的领导者目光短浅，自私自利，本质是农民阶级作为小有产者的局限性。具体而言，即石达开遭猜忌，负气出走；杨秀清，洪秀全二人围绕最高权力展开斗争，最后使得太平天国内部分裂，元气大伤。
关于统治集团与普通起义者的矛盾，则表现为，太平天国要求每家每户将所有粮食交到由“天国”控制的仓库，然后平均分配，这显然与太平军一开始起义时的“不纳钱粮”的口号相悖，这样一来，使得起义者的积极性大大降低。群众基础瓦解，则政权将焉存?
第二点，则是由于太平天国统治者目光短浅，缺少全局战略。首先，这体现就是在占领一个县城之后便建立国家，这样无疑会成为清政府重点讨伐的对象，相比当年朱元璋“缓称王”以积蓄力量，掩藏锋芒，洪秀全实在是没有战略眼光。
其次，还体现在，北伐军没有接应部队。北伐的目的，就是在于直捣北京，推翻清朝，如此重大的任务，必然要有前期周密的计划，安排好后续粮草，接应部队，援军。但在北伐军进军图中，可以发现，北伐军就是两支无援的孤军，孤军深入，结果必然是被剿灭。由此可见，太平军没有明确的战略，只是派兵四处攻打，之于输赢，像是在赌博，毫无战略目标。一个没有目标的起义团体，岂能有更大的发展?
其三，太平军内部在占领南京后，迅速腐化，失去了最初的起义志向。洪秀全大修宫殿，广纳美女填充后宫，据记载洪秀全的妻妾多达八十余位！在起义尚未成功，南京四周依旧充满危险之时，洪秀全等人已然声色犬马起来，岂有不败之理?
其四，太平天国的经济制度存在问题。其《天朝田亩制度》体现了绝对平均的思想，一方面没有实际可操作性；另一方面大大降低了农民的生产积极性。太平天国到最后军饷短缺，与其经济制度不无关系。之于后期的《资政新篇》，和太平天国农民阶级的阶级属性完全不相容，没有实行的土壤。制度的失败，必然导致政权的失败。
其五，由于清政府和外国势力的联合绞杀。清政府前期之所以屡屡讨伐太平天国失败，很大程度上是由于其战略重心在于英法两国，而无暇顾及太平天国。而1860年二次鸦片战争结束之后，清政府和英法签订条约，因此外患暂时缓解，使得清政府有更多经力对付太平天国；同时由于太平天国屡次去攻打上海，威胁到了上海外商的经济利益，而且，太平天国由于不承认列强在华利益，若清政府被推翻，则列强在华利益将受损，出于以上考虑，列强也组成洋枪队，协助清军围剿太平天国。在清政府和列强的合力围剿下，太平天国最终覆灭。
由此，太平天国的覆灭是必然的，因为它的领导阶级存在明显的局限性，内部矛盾突出，制度设计存在巨大漏洞，这些内部因素足以使之覆灭。加上清军和洋人的围剿，太平天国，更加无法逃脱失败的命运。