从医学哲学的角度来看，医学的本质是什么？
医学的本体论。医学哲学包含认识论、本体论/形而上学和医学伦理，重要的是医学伦理。而题主所问从医学哲学的角度看医学的本质是什么，那么涉及到的就是本体论或者形而上学的部分。
（1）使现代科学成为可能的本体论革命
（2）笛卡尔二元论，与现代医学的关系
（3）单因素致病论
（4）安慰剂和安慰剂效应
至于，涉及临床实践的本体论。则涉及基本医学术语的定义，如：疾病，疾病过程，诊断和患者等基本名词。而对这些基础概念的思考，有助于我们认识人类社会中的医学实践和理念的变迁。
疾病是什么？乍一看，“什么是疾病？”这个问题的答案相当简单，似乎每个人都可以毫不费力的回答它，至少我们中的大多数人都会认为我们对疾病有着直观的把握。但是，当我们了解得越多，就越会发现，要想严谨的定义疾病，是一件非常困难的事情。除非你把自己定义为正常，而任何和你不一样的都算成疾病。但这样的主观定义也行不通，因为这意味着你自己就不会生病了，而这显然是不可能的。以此类推，可以把一群人的平均状态定义为正常或者健康，而与之不同的就算成疾病，虽然在很多时候我们就这么干的，比如血压、血糖、心率啊等等。但是，运动员的心率比非运动员的要慢，同时身高恰好等于平均身高的也没多少人，因此平均值固然有助于帮我们判断正常和异常，健康和疾病，但它们都只能算辅助工具，无法用来做严谨精确的定义。
而什么算作疾病，也会在不同的历史时期发生变化，部分原因是对健康的期望越来越高，部分原因在于诊断能力的变化，但主要是由于社会和经济原因的影响。
所以，如果认为本质是永恒的和不可改变的，那么人类的医学是没有真正的本质的。
举两个例子吧，一个是生理上的（骨质疏松），另一个是性倾向上的（同性恋）。
比如：骨质疏松症，这本来是出现在老年人中的一个普遍生理现象，但自从这种现象在1994年被世界卫生组织正式认定为疾病后，骨质疏松就从正常的衰老现象变成了一种病理现象。而这根源于，骨质疏松会严重影响老年人生活质量，同时人们发现不同的人骨质疏松的程度差异很大，医学认为那些不怎么疏松的人才是正常和健康，反之则不够健康，在此基础上，制药公司开发出了极好的能治疗骨质疏松的药物，同时流行病学家则在健康宣传时，号召年轻人多运动，以对抗老年时的骨质疏松。
图示：紫外线促进维生素D合成，维生素D维持我们的骨骼健康。不过，紫外线对皮肤不好，同时还有致癌变的可能性，所以正午的太阳不能晒，一早一晚晒晒还是不错的。当然，也可以通过直接补充维生素D药丸的方式来避开晒太阳。
而另一个众所周知的例子则是同性恋，在二十世纪上半叶，同性恋被视为需要激素治疗的一种内分泌紊乱性疾病。后来又变成需要通过电休克治疗的精神疾病，或者需要通过神经外科手术进行治疗，最终这些极不人道的治疗被终止，1974年，在西方国家，同性恋不再被当做一种疾病对待。
我们如何恰当地区分真正的疾病，以及我们恰好发现令人不安的人类行为或特征？
当前，这个问题的讨论，主要集中在心理药物的使用上，最受人关注的现象是被诊断为注意力缺陷多动障碍（ADHD）的儿童数量越来越多。批评者认为ADHD的诊断，实际上是由于父母和学校无法控制行为不端的孩子，因此就寄希望于药物干预。
随着医学的不断进步，关于疾病和健康的范围也会不断发生改变，而且这其中还涉及到复杂的政治和经济的纠缠，远不是那么容易分清楚的。事情是如此错综复杂，以至于没有一个真正的因果关系，或者没有一个简单的因果关系存在着。而我们必须学会接受这一点，而这正是我们思考本质问题时得到的教益，没有一个简单的答案，比如医学的本质就是治病救人，或者掏空患者钱包。
要回答这个问题，先要解决三个分问题：
1、什么是哲学？
2、什么是本质？
3、什么是医学？
解决了这三个问题，才能讲清楚从哲学角度看医学的本质。
一、什么是哲学？哲学讲什么？
什么是哲学呢？简单讲，哲学就是智慧之学。那什么是智慧之学呢？就是让人通透明白，干净的学问。让人糊涂的学问，恐惧的学问不是哲学。如果让人恐惧的学问是哲学的话，那就叫魔鬼哲学。这是非正能量哲学，是邪恶之学。
关于这个说法，得解释一下。
我们的传统文化是这样定义的：智，五行属水，五常属智，这个智就是智力智慧的意思，五脏属肾，根据古中医讲，元气藏肾，中有真阳，这个阳，就智下面的那个日字，明莫过日，所以说一个人才智过人，也可以讲这个人聪明。智者乐水，也是这样来的哈。由此可见，智慧的第一个特征是明。
慧呢？丰丰扫走心，丰丰之谓大，大然后可以广，扫走旁，在心上，就是讲啊，用扫走把心上的尘土清理干净，心就宽广了。
所以，智慧的第二个特征是大，什么大，心大。
从以上内容可以大略看出：哲学是研究宏大的东西，包括世界本源，人生的意义，人和万物的最终归宿，人从哪里来等等这些人类社会世界的终极问题。
其它哲学古希腊哲学，古印度哲学，现代西方哲学，对于哲学的研究范围，研究对象，都是一样的哈。
二、什么是本质？就是事物的本来的固有的面目和属性。再具体讲就是本来的形体，本身的形体，固有的属性。
刘智《论天》：“言虚者，以为当日之冲，地体之荫，日光不至，谓之虚。凡光之所照，光体小於蔽，则大於本质。”
我们讲，刨去现象看本质。凡事物，有辅助性的内容，辅助性的包括：修饰，影藏（不是隐藏）。比如说这个长得漂亮。就是本质的描述，的确是身体长得好。如果说这个人漂亮。那就不一定是身体长得好了，有可能是衣服穿得好，有可能是会化妆，当然，也有可能是长得好，就有了三种本质可能性。判断的依据是不一样的，我们要准确判断，就要抓住本质，不要生出个娃不像爹也不像妈，丑死了，象隔壁老王，你还瞎猜疑，就是没有抓住本质，本质是自己的对象原本长得不好，只是衣服穿得好，会化妆，而刚好生出的娃像她而已。
正所谓：不蒙女史进，更失画师情。娥眉非本质，蝉鬓改真形。
用辩证唯物主义来看：现象和本质的关系见下图：（如不清楚，请去我微头条查看）
其它哲学观我们不讲。后面正式回答主题补充。
因为题主所问的是医学，目前主流医学是中医和西医，所以我们下面还要讲讲中国古代哲学对于事物本质的认识和方法论。
中国古代哲学认为：世界是由阴阳二气构成。物质的本质就是阴阳二气。用现代语言讲就是：世界是两种对立的东西构成的。他们是一体两面的，是相互包含的。用一个图来表示：太极图。
黑的代表阴，白的代表阳。
为了节约篇幅，详情我们看图说话：
注意：很多朋友把中国古代哲学的哲学和方法论弄得糊涂了，所以阴阳五行八卦的搅浆糊，自己在里面循环论证，各种口袋式的套装证明，洋洋洒洒，自己把自己都能整糊涂。
三、什么是医学？
现代对于医学是这样定义的：通过科学或技术的手段处理人体的各种疾病或病变的学科。是生物学的一个分支。
注意：（1）手段：用科学或者技术的手段。（2）、目的：处理人体的各种疾病或者病变（3）、是什么东西：一门学科。所以我们要清楚，题主问的医学这一学科的哲学本质。这叫审题，要不容易偏题。
从概念可以看出：科学或者技术而不是科学技术，“或”这个词就用得很准确，表明科学和技术是并列关系而不是决定和被决定关系。
科学和技术是两码事，这是很多人容易搞混淆的，民科们对于中西医之争，经常把科学和技术混为一谈。科学能解释某些技术和指导某些技术，发展某些技术。但科学不是技术的决定性因素，很多时候科学是走在技术后面或者前面的。技术是人们为了变革自然和社会所采取的一切物质手段、工具和方法的总和.科学是人们研究自然、社会、思维的本质及其规律所获得的一种知识体系.这是题外话，但对于回答本问题也很关键。因为下文会牵涉到从中国哲学怎么认识医学本质，从马克思辩证唯物主义怎么认识医学的本质。从机械唯物主义怎么看医学本质。
四、从哲学角度从医学哲学的角度来看，医学的本质是什么？
前面我们铺垫了那么多概念以及对于本质的认识和定义，目的就是为了让大家明白哲学和医学的逻辑。
了解了基本概念和定义，下面我们就可以从各种主流哲学观点：世界本源，人和万物从何处来何处去，来干什么，这四个方面回答这个问题了：
1、中国古代哲学认为：世界的本源是无。本质是阴阳。万物本于阴阳，天地万物和人是一体的。所以中医学的本质是纠偏扶正（阴阳平衡）的学科。目的是延年益寿，目标是好生好死。方法是“天人合一”，与自然和谐共处。
2、马克思辩证唯物主义哲学认为：世界的本源是物质的。人是物质世界的一部分。人认识自然改造的主观能动性，而改造自然的最重要的因素是工具人的生老病死是自然的生灭规律。所以，从马克思辩证唯物主义哲学来看：医学的本质是怎么使用工具的学问。用工具和技术来对抗自然的生老病死。也就是用医疗器械和医药来达到治病救人的目的。
3、机械唯物主义认为，世界的本源是原子（现代西方哲学从科学发展中，找到了原子的更多内部粒子）。人是由原子分子组成的细胞，组织，器官，系统的生化机器。人生病，主要是因为细菌，病毒，机械创伤等引起的。所以机械唯物主义哲学认为：医学的本质就是修复、更换病变、老化、创伤的器官和组织，甚至改变细胞（基因技术），隔离、杀灭（细菌、病毒）的学问。
4、宗教哲学认为世界以及万物都是是神创造的，人当然也是神创造的。人只能顺从神的旨意才能。认为人只要遵守教规，礼神敬神畏神，才不会生病。如果生病了，是因为人对神不敬或者亵渎了神灵。所以，宗教哲学认为医学的本质就是神学。生病了念念经，拜拜神就好了。
5、古希腊哲学和中国古代哲学差不多。略去不讲。印度哲学不是很了解，就不讲了。
综上所述，不同的哲学观，对于医学的本质有不同的认识。中国古代哲学认为医学的本质是纠偏扶正，以达到阴阳平衡的学科。有一系列的方法论理论体系和实践实用的中医学体系。机械唯物主义哲学认为人体是由“器官组织细胞等零配件”构成，所以在此哲学指导下的西医学认为医学是修复、更换器官组织等并杀灭、清除、改良影响这些零配件的物质的学问。其它的已经讲得很明白了，就不在此总结了。
回答完毕。