吴三桂为什么要自己杀死永历帝，而且要提议斩首这种方式？
擒下永历帝后，如何处置这位明朝最后的皇帝，就成了吴三桂的头等大事。吴三桂在与诸将商议时，提出要在云南把永历帝斩首示众，这又是为什么呢？
首先，对永历帝的处置最佳的方法就是押送北京，交给顺治或者继任的康熙处置，这也是看起来的最佳选择。因为这样一个身份敏感的大人物，无论是吴三桂，还是他从征的满清诸将，都无权自行处置，只能自行处置。不过吴三桂考虑到云南到京师路途遥远，要跨域几乎整个中国，夜长梦多，容易生变。
如果把永历帝献到京师，中间有反清复明的势力义士半途劫道，或者永历帝在半路自尽，这都会让朝廷对他擒获永历帝的功劳大打折扣。要知道当年明成祖朱棣夺了侄子的天下，建文帝下落不明就让他殚精竭虑了，更不要说刚刚入主中原统治远未巩固的满清。于是，吴三桂上奏朝廷，希望将永历帝在云南就地正法。这样有两个好处，一是保全自己的功劳，二则是消除朝廷对他的猜疑。这也吴三桂为什么一定要自己杀死永历帝的原因。
年幼的康熙皇帝同意了吴三桂的奏折，下旨将永历在云南处死。那么第二个问题就来了，该如何处死永历帝呢？清朝刑法一向严酷，对于后世所谓的“朱三太子”一向是处以凌迟之刑，此外还可以斩首、毒杀、勒死等等，吴三桂可以自行选择。吴三桂提议斩首，这让与吴三桂一起平定云南、擒获朱由榔的定西将军舒穆禄·爱星阿非常不满意。爱星阿表示拥立帝虽是敌人，但毕竟曾为天子，是一国之主，要是把他斩首实在过于凄惨，应该赐予自尽。安南将军佟佳·卓罗也说，朱由榔曾经当过皇帝，要留全尸，没必要斩首。
其实，吴三桂之所以这么提议，未必他内心就是这么想的。他作为一个汉人，要是提出给永历帝留全尸的想法不免会让满人觉得他心眷故主，怀疑他的忠诚。而要是提议凌迟，又不免太过残酷，让满清统治者觉得他冷酷无情，更不敢放心他。从吴三桂内心而言，他未必想对永历帝有过什么酷刑的方法，所以当满清将领爱星阿、卓罗出于同情，提出留全尸的时候，他也就顺水推舟的答应了。爱星阿、卓罗都是满清开国元勋的后代，他们的祖上都追随努尔哈赤、皇太极立下大功，自身也是功勋卓著，由他们说出来的话，显然要比吴三桂自己更能让朝廷的康熙、孝庄、索尼、鳌拜接受。
于是，康熙元年六月一日，永历帝父子及眷属25人在昆明篦子坡遭吴国贵用弓弦勒死，终年40岁。