靖难之役时，朱允炆为何下旨任何人不得诛杀朱棣？
正是这道口谕，朱棣在四年的靖难之役中，才敢亲冒矢石，在两军阵前纵横驰骋，毫发无损。联想到建文初年，徐达之子徐辉祖曾力劝建文帝扣押朱棣之子来要挟对方。建文帝犹豫着，居然没有同意。结果放虎归山，让朱棣再无顾忌。其次方孝孺向建文帝推荐了平叛的主帅：他的好友李景隆。
正是李景隆其人既打了败仗，又打开了金川门迎贼。在此之前，早已有人对建文帝说过，李景隆有异志。但建文帝却因为相信方孝孺，而对李景隆信任有加。正是建文帝的优柔寡断，目不识人，才等来了误国的开门之变。{“帝雅信孝孺，遂不复疑，坐成开门之变，盖不免于误国云。《姜氏秘史》}
等到方孝孺如梦初醒，要求建文帝诛杀李景隆时，一切为时已晚。最后朱棣在率军渡过长江，南京城危在旦夕时，方孝孺又给朱允炆提供了一个错误的建议。他建议朱允炆固守京城以待援兵，如果最终失败，应当君王死社稷。
眼看南京城不保，有人劝说建文帝暂避锋芒，毕竟大半个国家，仍在建文帝的控制中。可方孝孺却力主守城，等待援兵。这样的结果是，陈碹以战舰降燕王，李景隆打开了城门，建文帝本人也消失在了一场大火之中。
朱元璋把儿孙分封到各地做藩王，藩王的势力日渐强盛。因太子朱标早死，皇太孙朱允炆继位，其年号为建文。建文帝与亲信大臣黄子澄，齐泰布置了一系列的削藩措施。他们决定先削那些实力弱小的藩王。在削除弱小的诸王以后，朱允炆认为一切已经准备停当，他便秘密下令擒拿朱棣，但是朱允炆并没有成功。
因为削蕃措施严重侵害到了藩王的利益，所以1399年坐镇北平的朱棣，起兵反抗。靖难之役持续了四年的时间，此时建文帝已经没有大将可用。他只能启用幸存的老将耿炳文率兵北伐，随后他又派出李景隆继续北伐。
建文帝派出去的军队，主力不断被歼灭。朱棣以北平为基地，灵活运用策略，适时出击。几次大型消灭战过后，朱棣选择了乘胜进军。公元1402年朱棣攻下应天，战乱中朱允炆下落不明，同年朱棣继位，史称明成祖。