朱元璋称帝后，为什么对红巾军污名化，反而认同元朝是正统？
而朱元璋，当然有自己的动机。
内心矛盾的朱元璋
其实人类往往都有内心矛盾的时候。比如我认识不少鸡娃家长，他们一方面认为自己的娃肯定是千年不遇的天才，必然改变人类世界，在世纪科学史留下自己的篇章，但另一方面，又十分担心自己的孩子会不会连普高都考不上。虽然这前后看起来反差很大，但却也反映了鸡娃家长的矛盾内心。
同样道理，朱元璋也是充满矛盾心理的人。一方面，朱元璋是通过参加红巾军起家，同时利用韩宋朝廷的旗号，在元末乱世中实现了壮大，最终成为新的王朝开创者。朱元璋很清楚，没有任何一个王朝会千秋万代。但是另一方面，朱元璋又期盼明朝会是一个例外：因此，朱元璋需要做的，就是给明朝拔出所有的隐患。
因此朱元璋总结以往历朝历代的得失，通过制度设计，杜绝了权臣、宦官专权、地方割据这些情况。而对于农民起义，朱元璋也想到了很多办法。
朱元璋的策略
出身于红巾军的朱元璋很清楚农民起义的威力。因此，朱元璋开始限制明朝百姓的人身自由，不断打压商人的地位，对白莲教等秘密宗教穷追猛打。同时，为了让天下百姓骨子里不考虑造反的事情，朱元璋开始修订明朝百姓的集体记忆。
首先，朱元璋开始针对同他有养育之恩的红巾军进行污名化宣传，把红巾军说成盗匪，对于他昔日的恩人韩宋朝廷，朱元璋更是将其视为大元朝的乱臣贼子。
而对于自己取代元朝，朱元璋是这样阐述的：元朝末年，因为元顺帝无能，所以天下大乱。红巾“贼”事实上推翻了元朝。而自己本是元朝的孝子贤孙，自己起兵，是为了收拾元朝留下的残局，而非为了推翻元朝。
为了表明自己对农民起义的敌视，同时表示自己并非元朝的乱臣贼子，朱元璋还宣布承认元的正统性，并且祭祀元世祖忽必烈。
朱元璋这也是暗示天下百姓：不要以为红巾军胜利了。参加任何农民军都是没有前途的。虽然元朝结束了统治，但是，胜利者并非是红巾军，而是元朝的继承者明朝。只有服从朝廷，才算最有前途的。
敏感的朱元璋
当然，尽管朱元璋幻想通过强制手段，修订明朝人的集体记忆。但是，很多元末局势的亲历者，也还是很清楚朱元璋的情况。因此，很多知识分子对朱元璋的品格表示不屑。而朱元璋也变得异常敏感：比如如果有大臣上书，提到“则”“僧”这样的字样，就会被朱元璋联想到：则，和贼发音类似，会不会是嘲笑自己参加过红巾军？僧、生，会不会是嘲讽自己做过和尚？
为此，很多明朝大臣，都无端遭遇朱元璋的杀戮。