汉灵帝废宋皇后导致曹操被免官，曹仁是否遭到连累不得而知
光和元年（178年），中常侍王甫枉因为与勃海王刘悝结怨，诬告刘悝谋反，致使其下狱自杀，其王妃宋氏也因此丧命，而宋氏是汉灵帝宋皇后的姑母，所以王甫担心宋皇后会为姑母、姑父申冤，牵扯出自己，于是先下手为强，诬告宋皇后在宫中行巫蛊之术。宋皇后本不得宠，故而汉灵帝听信诬告，“后无宠而居正位，后宫幸姬众，共谮毁。初，中常侍王甫枉诛勃海王悝及妃宋氏，妃即后之姑也。甫恐后怨之，乃与太中大夫程阿共构言皇后挟左道祝诅，帝信之。”废后，宋皇后最终死于冷宫。其父执金吾、不其乡侯宋酆和几个儿子也被王甫斩草除根，全部杀害。“光和元年冬十月，皇后宋氏废，后父执金吾酆下狱死。”“后自致暴室，以忧死。在位八年。父及兄弟并被诛。诸常侍、小黄门在省闼者，皆怜宋氏无辜，共合钱物，收葬废后及酆父子，归宋氏旧茔皋门亭。”
“帝后梦见桓帝怒曰：‘宋皇后有何罪过，而听用邪孽，使绝其命？勃海王悝既已自贬，又受诛毙。今宋氏及悝自诉于天，上帝震怒，罪在难救。’梦殊明察。帝既觉而恐，以事问于羽林左监许永曰：‘此何祥？其可攘乎？’永对曰：‘宋皇后亲与陛下共承宗庙，母临万国，历年已久，海内蒙化，过恶无闻。而虚听谗妒之说，以致无辜之罪，身婴极诛，祸及家族，天下臣妾，咸为怨痛。勃海王悝，桓帝母弟也。处国奉藩，未尝有过。陛下曾不证审，遂伏其辜。昔晋侯失刑，亦梦大厉被发属地。天道明察，鬼神难诬。宜并改葬，以安冤魂。反宋后之徙家，复勃海之先封，以消厥咎。’帝弗能用，寻亦崩焉。”
宋酆的儿子中有一个叫做宋奇，封濦强侯，也在宋皇后一案中被杀。宋奇的妻子是沛国谯县人，侍中、太中大夫、长水校尉曹炽的女儿。曹炽的父亲曹褒是曹操祖父曹腾的哥哥（曹操之父曹嵩为曹腾养子，曹嵩出自夏侯氏一说并不可信，其实很有可能就是曹褒的儿子），所以曹炽是曹操的堂叔，曹炽的儿子就是后来随同曹操起兵，立下汗马功劳的曹仁、曹纯。
宋奇因为岳父的关系认识了曹操，曹操也对这个从妹夫很看重，二人关系很好。宋奇被杀，时任顿丘令的曹操被免官，回乡。相比而言，宋奇是曹操的从妹夫，却是曹仁的亲妹夫，曹仁的关系确实比曹操更近，似乎应该受到更重的惩罚。但是没有这方面记载，原因可能如下：
第一，与宋皇后关系已经很远，未必要受牵连
宋皇后被认为是行巫蛊之术，牵连到兄弟宋奇很正常，但再要牵连到宋奇的大舅哥曹仁就太远了，犯不上。曹操虽然关系更远，但被免官很可能是因为曹操自己得罪人（曾在洛阳北部尉任上打死当权宦官蹇硕的叔父蹇图），被人借此事趁机打击而免官。如果曹操平时结交权贵，妥善打点，可能也不会受牵连。
曹仁
第二，受牵连也仅仅是免官，而曹仁不是官，无官可免
就算要受牵连，曹操这样免官也就是了。曹仁早年没有做官。《三国志•诸夏侯曹传》记载曹仁早年经历：“曹仁字子孝，太祖从弟也。少好弓马弋猎。后豪杰并起，仁亦阴结少年，得千馀人，周旋淮、泗之间 ，遂从太祖为别部司马，行厉锋校尉。”曹仁只是结交一些江湖豪杰，在各处游荡。后来曹操起兵才去投奔。因此，在宋皇后案时，他根本不是官，无官可免，也就不需要什么进一步的处罚了。
第三，曹仁或许受到了牵连，因此才当不了官
另有一种可能，曹仁真的受到了牵连，所以他才“周旋淮、泗之间”。当时曹家也是名门望族。汉代用察举制选拔官吏，曹仁的出身，当官原本不难。但他却外出游荡，可能正是因为受到大舅哥宋奇的牵连，有了“案底”，没法获得推荐进入仕途，才只能四处游荡。甚至不排除他为了逃避处罚而出走。都是不可知的。